Стоян Тонев е водач на листа на ГЕРБ и е сред авторите на бъдещата политика в здравеопазването в партията. В момента е заместник-кмет на Столичната община в направление „Столично общинско здравеопазване“. Той е началник на Военномедицинска академия (ВМА) в периода от 2002 г. до 2014 г. Работил е като началник-отделение в Клиниката по кожни и венерически заболявания към ВВМИ; заместник-началник и началник на Клиниката по кожни и венерически болести във ВМА, професор е по дерматология….